勞務派遣屬于人力資源服務，適用稅率是6%，按照財稅〔2016〕47號，可以選擇差額納稅，以取得的全部價款和價外費用，扣除代用工單位支付給勞務派遣員工的工資、福利和為其辦理社會保險及住房公積金后的余額為銷售額，按照簡易計稅方法依5%的征收率計算繳納增值稅。

勞務外包，則應按照其業務實質，全額計算繳納增值稅。比如，外包的是加工、修理修配勞務，則承包單位應按提供加工、修理修配勞務的計稅規則全額計算繳納增值稅；外包的如果是建筑服務，則承包單位應按提供建筑服務的規定計算繳納增值稅（一般納稅人9%或小規模納稅人3%）。

主要區別有以下幾點：

（一）資質要求

勞務派遣公司必須取得人力資源部門核發的勞務派遣資質證書。

（二）簽訂的合同不同

一是勞務派遣公司應依法與被派遣的勞動者簽訂規范的勞動合同，并按照人力資源部門的要求實行網上備案。勞動合同中應載明被派遣的勞動者的用工單位、派遣期限、崗位等情況；

二是勞務派遣公司應與用工單位簽訂勞務派遣合同，載明被派遣人員的工資、保險、公積金等數額。

（三）是否通過金融機構支付工資

勞務派遣公司支付給被派遣勞動者的工資必須通過銀行轉賬方式，要有明細的銀行流水單據。

（四）扣除憑證不同

扣除憑證除了第二項中的兩個合同和第三項中的銀行單據之外，還需要勞務派遣公司的花名冊、用工單位的花名冊、勞務派遣公司和用工單位的工資核算明細賬，以及勞務派遣公司為勞動者繳納社會保險的繳費憑證。

（五）發票開具不同

選擇差額征稅的，扣除的差額部分不得開具專用發票，可以通過防偽稅控系統的差額開票功能，差額開具發票。同時，需要在備注欄中備注上支付給勞動者的工資和五險一金的數額。

（六）加強對勞務派遣公司和用工單位的企業所得稅年度審核鑒證

嚴格執行國稅函（2009）3號和2015年34號公告，不符合規定的工資和福利費，不允許稅前扣除，更防止一筆工資兩頭扣除。

（七）加強部門協作

營改增前成立的勞務派遣公司，企業所得稅一般都在稅務部門可信息共享，協調辦案。同時，稅務、工商、人力資源、銀行等部門，可聯合加強對勞務派遣的監督管理，實現信息共享，業務互通。